汉武帝元狩二年(前121年),更设鄣郡为丹阳郡,今湖州市安吉县一带属丹阳郡故鄣县。东汉建立后,该地区仍属丹阳郡故鄣县。到了公元185年,也即东汉末年,割故鄣县南境设立安吉县,县治设于天目乡(今孝丰镇),仍属丹阳郡。安吉县建县于汉中平二年(185年),取《诗经》“安且吉兮”之意得名,是古越国重要的活动地和秦三十六郡之一的古鄣郡郡治所在地。由此,就安吉县来说,已有1800多年的建制历史了。进入到三国时期,魏蜀吴三国鼎立,今安吉县一带成为东吴的疆域。就东吴大将朱然,就出生在该地区。
三国东吴乌程侯宝鼎元年(266年),设立吴兴郡,安吉县属之。南北朝时期,该地区的建制和归属变化较大,并且,安吉县这一建制被废除。隋仁寿二年(602年),以地滨太湖而名“湖州”,今安吉县一带属之。唐麟德元年(664年),恢复安吉县建制,隶湖州。开元二十六年(738年),唐玄宗李隆基这位皇帝在位时,将安吉县县治北移至今安城镇址附近。五代十国时期,安吉县仍属湖州。北宋建立后,设立安吉州,今安吉县一带属之。元朝建立后,升安吉州为湖州路。

最后,在元朝时期,湖州路属江浙行省。朱元璋建立明朝后,安吉县属浙江承宣布政使司湖州府。清朝取代明朝后,安吉县属浙江省湖州府。到了1914年,安吉县属钱塘道。1928年,安吉县直属于浙江省。1983年8月,撤销嘉兴地区,分设嘉兴、湖州市。在此基础上,湖州市辖吴兴、南浔两个市辖区及长兴、德清、安吉三县。如今,安吉县隶属于浙江省湖州市。截至2018年底,安吉县总面积达1885.71平方公里,总人口约为46.6万人。